Die derzeitige Wehranlage Mühlendamm besteht im Wesentlichen aus zwei einzelnen Bauelementen: die Mole zum Wehrarm im Oberwasser und dem Wehrverschluss.
Die zugehörige Doppelschleuse ist in Fließrichtung, auf der rechten Seite der Spree, ca. 100 m oberhalb der Mühlendammbrücke angeordnet.
Die Mole verläuft über eine Gesamtlänge von ca. 100 m von der linken Schleusenkammer zum Widerlager der Mühlendammbrücke.
Die Mole setzt sich unterhalb des Wehres als ca. 25m lange Trennwand zum Schifffahrtsweg fort. In Verlängerung der steinernen Mole befindet sich ein ca. 60 m langes Leitwerk.
Die Schleusenanlage Mühlendamm steht einschließlich Wehranlage und Mole unter Denkmalschutz.
Am Wehr Mühlendamm wurde der Bauwerksteil zwischen den Revisionsverschlüssen (Stahlwasserbau, Massivbau) im Zuge der Bauwerksinspektionen immer wieder begutachtet. Teile des Korrosionsschutzes am Wehrverschluss und des Sohlbetons wurden saniert.
Für die anderen Bauteile fehlen Unterlagen und Kennwerte, um eine Begutachtung vornehmen zu können.
Die Wehranlage wurde in den letzten Jahren untersucht, um die Restnutzungsdauer zur Standsicherheit und die Gebrauchstauglichkeit festzulegen.
Dazu liegt seit dem Frühjahr 2014 ein Gutachten vor, welches u.a. den Neubau des Wehres Mühlendamm empfiehlt.
Des Weiteren ist die Staustufe Mühlendamm heute für flussaufwärts wandernde aquatische Organismen weitgehend unpassierbar.
Die Errichtung einer Fischaufstiegsanlage (FAA) im Bereich der Staustufe Mühlendamm ist Bestandteil des Konzeptes der Flussgebietsgemeinschaft Elbe zur Wiederherstellung der Durchgängigkeit für Langdistanzwanderfische in den überregionalen Vorranggewässern. Mit dieser Maßnahme wird die ökologisch dringend gebotene Durchgängigkeit für aquatische Organismen im Übergangsbereich von der Unterhavel zur Spree wiederhergestellt.
Das Baufeld liegt im innerststädtischen Bereich zwischen Wohnbebauung und Botschaften, inmitten städtischer Infrastruktur wie Brücken, Tunneln, Bundesstraßen, U-Bahn, Schleuse und Schiffsverkehr.
Gleichzeitig erfolgt in unmittelbarer Nähe der Bau der Mühlendammbrücke und des Waisentunnels.