Frist abgelaufen

Beschaffung von Standardsoftware: LC-HRMS-Software

Die Angebotsfrist ist am 12. Juli 2024 abgelaufen. Das Verfahren befindet sich in der Zuschlags- bzw. Abschlussphase. Ähnliche aktuelle Ausschreibungen ansehen ↓
Auftraggeber
Veröffentlicht
08.07.2024
Angebotsfrist
12.07.2024
Bereitstellung einer Software zur Analyse von Daten aus der hochauflösendenen Flüssigkeitschromatographie-Massenspektrometrie-Gerätekopplung (engl.: Liquid chromatography-high-resolution-mass spectrometry, kurz: LC-HRMS) unter Berücksichtigung folgender Anforderungen: Programmierumgebung R, Importierung von Messdaten-Files verschiedener Messgerätesetups im Format .mzXML, Erstellung von Compound-Listen, automatische Extrahierung von Chromatogrammen und Peaks, Quantifizierungsmöglichkeiten und Qualitätskontrolle. Des Weiteren sollte die Software die Möglichkeit für statistische Big-Data-Analysen mit angeschlossener Datenbank, insbesondere für das Langzeitmonitoring bieten. Bereitstellung der Software für einen Zeitraum von 2 Jahren. Die Software muss vollständig geliefert werden, einschließlich aller erforderlichen Komponenten und Lizenzen.

Zeitplan

Veröffentlichung
08.07.24
Fragenfrist
12.07.24
Abgabefrist
12.07.24

Ausschreibung

Reichweite
EU-weit
Vergabeart
de-open
Erfüllungsort
Bonn, Deutschland
E-Mail
ticket@bescha.bund.de
Telefon
0228 99 610 1234

Eignungs- & Bewertungskriterien

Eignungskriterien

  • Die Software muss Funktionen zur Analyse von LC-HRMS Daten enthalten. Die Anforderungen sind hierbei

    • Programmierumgebung R, Import von Rohmessdaten verschiedener Messgeräte im offenen Format .mzXML zur Auswertung von Messdaten unterschiedlicher Labore, Erstellung von Compound-Listen, automatische Extrahierung von Chromatogrammen, Peaks und MS2-Spektren, Zuordnung der zugehörigen Isotopen, Addukte und MS2-Spektren zu einem Feature (Komponentisierung) und sogenanntes Alignment über verschiedene Proben einer Messung oder über Zeitreihen, Korrektur von Hintergrundwerten, Normalisierung der Messdaten auf interne Standards, Quantifizierungsmöglichkeiten und Qualitätskontrolle. Des Weiteren sollte die Software die Möglichkeit für statistische Big-Data-Analysen von Langzeitmessreihen mit angeschlossener Datenbank und eine Schnittstelle zum NTS-Portal des Bundes bieten. Die Datenbank soll ein Modul zur Verwaltung von Probenahmestellen (beispielsweise Name, Ort, Gewässer, Georeferenz) und Proben (beispielsweise Probenummer, Matrix, Zeit, Datum) beinhalten. Die Ergebnisse eines jeden Schritts der Prozessierung sollen in einem offenen Format zugänglich oder exportierbar sein, beispielsweise zur Weiterverwendung in externen Programmen oder zur Qualitätssicherung der gesamten Analysenpipeline.
    • Ein weiterer wichtiger Eignungsfaktor ist, dass die Software die Möglichkeit bietet, die Ergebnisdateien zu exportieren, so dass Datenüberprüfungen mit dem NTS-Portal unter Verwendung der Programmierumgebung R und Python möglich sind.

Zuschlagskriterien

  • Die Qualität des angebotenen Produktes wird anhand der Produktmerkmale bewertet. Dabei werden Eignungskriterien überprüft, die in der Leistungsbeschreibung (siehe Leistungsbeschreibung 3.1) beschrieben werden (Gewichtung

    • 60%).
    • Der Preis umfasst den Gesamtbetrag für das angebotene Produkt, einschließlich aller damit verbundenen Kosten und Gebühren. Ein niedriger Angebotspreis erhält eine höhere Punktezahl in diesem Kriterium (Gewichtung: 40%).

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Vergabeunterlagen

Präsentation156 KB24 Seiten
Vertragsbedingungen78 KB4 Seiten
Vertragsentwurf37 KB8 Seiten
Kalkulation203 KB2 Tabellen
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